MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mannheimia haemolytica M42548

Total Repeats: 53188

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021082	ATC	2	6	233876	233881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884938
4502	NC_021082	CA	3	6	233888	233893	50 %	0 %	0 %	50 %	482884938
4503	NC_021082	GGC	2	6	234038	234043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884938
4504	NC_021082	TGA	2	6	234148	234153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884938
4505	NC_021082	ATT	2	6	234218	234223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884938
4506	NC_021082	A	6	6	234318	234323	100 %	0 %	0 %	0 %	482884938
4507	NC_021082	CTA	2	6	234453	234458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884938
4508	NC_021082	TACCG	2	10	234524	234533	20 %	20 %	20 %	40 %	482884938
4509	NC_021082	GCT	2	6	234540	234545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884938
4510	NC_021082	AAT	2	6	234567	234572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884938
4511	NC_021082	GCC	2	6	234618	234623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884938
4512	NC_021082	GAGC	2	8	234638	234645	25 %	0 %	50 %	25 %	482884938
4513	NC_021082	GCC	2	6	234657	234662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884938
4514	NC_021082	CGG	2	6	234704	234709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884938
4515	NC_021082	CAC	2	6	234740	234745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884938
4516	NC_021082	CGG	2	6	234921	234926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884938
4517	NC_021082	AAT	2	6	234947	234952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884938
4518	NC_021082	GTT	2	6	234977	234982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_021082	T	6	6	234992	234997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_021082	TA	3	6	235000	235005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_021082	GCCC	2	8	235027	235034	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4522	NC_021082	A	6	6	235088	235093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_021082	TTAA	2	8	235094	235101	50 %	50 %	0 %	0 %	482884939
4524	NC_021082	GTT	2	6	235223	235228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884939
4525	NC_021082	TCA	2	6	235239	235244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884939
4526	NC_021082	GTG	2	6	235257	235262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884939
4527	NC_021082	TTA	2	6	235269	235274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884939
4528	NC_021082	T	7	7	235394	235400	0 %	100 %	0 %	0 %	482884939
4529	NC_021082	TCA	2	6	235438	235443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884939
4530	NC_021082	TGCC	2	8	235471	235478	0 %	25 %	25 %	50 %	482884940
4531	NC_021082	CGG	2	6	235494	235499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884940
4532	NC_021082	TAA	2	6	235549	235554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884940
4533	NC_021082	CTA	2	6	235560	235565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884940
4534	NC_021082	GTT	2	6	235581	235586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884940
4535	NC_021082	AAT	2	6	235682	235687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884940
4536	NC_021082	AAT	2	6	235735	235740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884940
4537	NC_021082	CAT	3	9	235815	235823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884940
4538	NC_021082	TTG	2	6	235834	235839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884940
4539	NC_021082	AAAC	2	8	235871	235878	75 %	0 %	0 %	25 %	482884940
4540	NC_021082	CCA	2	6	236037	236042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884940
4541	NC_021082	CGC	2	6	236083	236088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884940
4542	NC_021082	AAT	2	6	236119	236124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884940
4543	NC_021082	T	6	6	236145	236150	0 %	100 %	0 %	0 %	482884940
4544	NC_021082	A	7	7	236178	236184	100 %	0 %	0 %	0 %	482884940
4545	NC_021082	T	7	7	236267	236273	0 %	100 %	0 %	0 %	482884940
4546	NC_021082	TTG	2	6	236314	236319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884941
4547	NC_021082	CT	3	6	236390	236395	0 %	50 %	0 %	50 %	482884941
4548	NC_021082	TTC	2	6	236476	236481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884942
4549	NC_021082	CTT	2	6	236544	236549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884942
4550	NC_021082	TGG	2	6	236633	236638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884942
4551	NC_021082	TTC	2	6	236640	236645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884942
4552	NC_021082	TGGCAT	2	12	236673	236684	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	482884942
4553	NC_021082	TCAC	2	8	236729	236736	25 %	25 %	0 %	50 %	482884942
4554	NC_021082	T	6	6	236768	236773	0 %	100 %	0 %	0 %	482884942
4555	NC_021082	TAC	2	6	236845	236850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884942
4556	NC_021082	GTT	2	6	236862	236867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884942
4557	NC_021082	CCA	2	6	236901	236906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884942
4558	NC_021082	T	7	7	237131	237137	0 %	100 %	0 %	0 %	482884942
4559	NC_021082	CGG	2	6	237151	237156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884942
4560	NC_021082	ATC	2	6	237169	237174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884942
4561	NC_021082	GTTT	2	8	237195	237202	0 %	75 %	25 %	0 %	482884942
4562	NC_021082	A	6	6	237284	237289	100 %	0 %	0 %	0 %	482884942
4563	NC_021082	A	6	6	237328	237333	100 %	0 %	0 %	0 %	482884942
4564	NC_021082	TGT	2	6	237361	237366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884942
4565	NC_021082	ATTTTA	2	12	237456	237467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_021082	CCGAAA	2	12	237524	237535	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	482884943
4567	NC_021082	GCGATT	2	12	237619	237630	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	482884943
4568	NC_021082	TGC	2	6	237710	237715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884943
4569	NC_021082	T	6	6	237741	237746	0 %	100 %	0 %	0 %	482884943
4570	NC_021082	CTG	2	6	237748	237753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884943
4571	NC_021082	TGC	2	6	237822	237827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884943
4572	NC_021082	TGC	2	6	237873	237878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884943
4573	NC_021082	TGT	2	6	237887	237892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884943
4574	NC_021082	CGG	2	6	237933	237938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884943
4575	NC_021082	TTA	2	6	238009	238014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884943
4576	NC_021082	CAT	2	6	238041	238046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884943
4577	NC_021082	ACT	2	6	238049	238054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884943
4578	NC_021082	AAC	2	6	238057	238062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884943
4579	NC_021082	GTA	2	6	238183	238188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884943
4580	NC_021082	TTG	2	6	238223	238228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884943
4581	NC_021082	GCA	2	6	238261	238266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884943
4582	NC_021082	A	6	6	238382	238387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_021082	T	6	6	238402	238407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_021082	AAT	2	6	238453	238458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_021082	CTT	2	6	238563	238568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884944
4586	NC_021082	CTT	2	6	238570	238575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884944
4587	NC_021082	GAA	2	6	238634	238639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884944
4588	NC_021082	TGG	2	6	238669	238674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884944
4589	NC_021082	TCG	2	6	238684	238689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884944
4590	NC_021082	ATC	2	6	238745	238750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884944
4591	NC_021082	ATA	2	6	238836	238841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884944
4592	NC_021082	CTT	2	6	238888	238893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884944
4593	NC_021082	ATT	2	6	238928	238933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884944
4594	NC_021082	GTT	2	6	238945	238950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884944
4595	NC_021082	AATA	2	8	238971	238978	75 %	25 %	0 %	0 %	482884944
4596	NC_021082	A	7	7	238984	238990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_021082	ACCG	2	8	238999	239006	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4598	NC_021082	T	6	6	239016	239021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_021082	ACT	2	6	239022	239027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884945
4600	NC_021082	TGC	2	6	239063	239068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884945
4601	NC_021082	AGC	2	6	239080	239085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884945
4602	NC_021082	ATG	2	6	239124	239129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884945
4603	NC_021082	T	7	7	239149	239155	0 %	100 %	0 %	0 %	482884945
4604	NC_021082	ATTC	2	8	239232	239239	25 %	50 %	0 %	25 %	482884945
4605	NC_021082	AATT	2	8	239271	239278	50 %	50 %	0 %	0 %	482884945
4606	NC_021082	TGA	2	6	239420	239425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884945
4607	NC_021082	CCA	2	6	239504	239509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884945
4608	NC_021082	TTC	2	6	239572	239577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884945
4609	NC_021082	T	6	6	239582	239587	0 %	100 %	0 %	0 %	482884945
4610	NC_021082	CCA	2	6	239654	239659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884945
4611	NC_021082	GCG	2	6	239676	239681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884945
4612	NC_021082	AGC	2	6	239707	239712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884945
4613	NC_021082	CAC	2	6	239907	239912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884945
4614	NC_021082	GAG	2	6	239922	239927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482884945
4615	NC_021082	TAA	2	6	239967	239972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884945
4616	NC_021082	A	6	6	239996	240001	100 %	0 %	0 %	0 %	482884945
4617	NC_021082	TCCTT	2	10	240026	240035	0 %	60 %	0 %	40 %	482884945
4618	NC_021082	TAA	2	6	240100	240105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884945
4619	NC_021082	TTTC	2	8	240123	240130	0 %	75 %	0 %	25 %	482884945
4620	NC_021082	GCC	2	6	240173	240178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884945
4621	NC_021082	CCA	2	6	240188	240193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884945
4622	NC_021082	ATG	2	6	240203	240208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884945
4623	NC_021082	ACA	2	6	240209	240214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884945
4624	NC_021082	T	7	7	240248	240254	0 %	100 %	0 %	0 %	482884945
4625	NC_021082	AAC	2	6	240307	240312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884945
4626	NC_021082	ATT	2	6	240473	240478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_021082	TCA	2	6	240501	240506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4628	NC_021082	GCA	2	6	240610	240615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884946
4629	NC_021082	A	6	6	240652	240657	100 %	0 %	0 %	0 %	482884946
4630	NC_021082	TTA	2	6	240789	240794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884946
4631	NC_021082	GCAAA	2	10	240869	240878	60 %	0 %	20 %	20 %	482884946
4632	NC_021082	GTAC	2	8	240951	240958	25 %	25 %	25 %	25 %	482884946
4633	NC_021082	ACCTT	2	10	240990	240999	20 %	40 %	0 %	40 %	482884946
4634	NC_021082	TGA	2	6	241037	241042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884946
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4636	NC_021082	T	6	6	241171	241176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4637	NC_021082	AGAA	2	8	241186	241193	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4638	NC_021082	GCA	2	6	241229	241234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884947
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4646	NC_021082	TTC	2	6	241599	241604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884947
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4654	NC_021082	CG	3	6	241905	241910	0 %	0 %	50 %	50 %	482884947
4655	NC_021082	TGC	2	6	242022	242027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884947
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4659	NC_021082	ATA	2	6	242143	242148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4660	NC_021082	AAGG	2	8	242184	242191	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4667	NC_021082	A	6	6	242451	242456	100 %	0 %	0 %	0 %	482884948
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4743	NC_021082	CTC	2	6	246462	246467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482884952
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4746	NC_021082	ATC	2	6	246585	246590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884952
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